甲賀忍法帖漫畫，慶長19年，73歲高齡的德川家康為了第三代將軍繼承人人選的問題而煩惱。是愚笨的哥哥竹千代，還是天資聰慧的弟弟國千代。在這亂世裡第三代將軍的繼承問題落到了兩大忍術宗家－－甲賀流和伊賀流的身上。家康決定由兩家各派出10名最優秀的忍者（真人電影版中為各5名），進行一場生死大對決，兩派之中倖存下來的一方將得到千年的榮祿，並由其支援的一方繼承人繼承將軍的名號。 甲賀首領甲賀彈正和伊賀首領阿幻，在家康的默許下親手撕毀了兩派在前代服部半藏調停下籤訂的“不戰條約”。兩派瞬間走向一場死鬥。同時彈正的孫子弦之介，和阿幻的孫女朧，不得不放下婚約，為殺死自己的愛人而戰……
